这是人类的体内。                                                                    　　许许多多的细胞勤奋工作的世界。                                                                    　　某日白细胞(中性粒细胞)与红细胞，遇见了收留迷路乳酸菌的一般细胞。为了将乳酸菌护送至同伴身边，白细胞(中性粒细胞)与一般细胞向肠道出发。                                                                    　　然而他们却与来者不善的最强敌人重逢。                                                                    　　「我和你们到底谁才是正义的一方，趁这次弄个清楚吧」                                                                    　　再次现身的癌细胞。以及遭到坏菌破坏的肠内环境。                                                                    　　体内遭遇前所未有的大危机！？                                                                    　　「束手就擒吧 癌细胞！」                                                                    　　为了守护这个世界，白细胞们(中性粒细胞)向赌上世界命运的大战发起挑战。

《工作细胞中配版》故事主线是典型的黑暗童话风格，动漫以童年记忆与生活感触为核心，整体充满了人情冷暖、世态炎凉的洗礼，配音宛如天籁，影片的设计堪称艺术与娱乐的高度结合。画风色彩浓重，角色设计层次与细节分明，剧情在看似轻松诙谐的情节下献予了太多动人的感动，特效追求奇、趣、美，是一部诱发着对青春真切深思的动画片。