因为偷税事件，曾经处于精英组的百合根友久（冈田将生饰）被踢到早先成立的科学搜查班（ST）担任指挥官，通过之前的合作，虽然百合根始终未能完全接受青山翔（志田未来饰）、结城翠（芦名星饰）、黑崎勇治（漥田正孝饰）、山吹才藏（三宅弘城饰）以及ST实际领导者赤城左门（藤原龙也饰）这群怪人的行径，却也为他们自身那极度专业和见斥于周遭的气息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一课，一面又打算多守护ST的各位一段时间。随着作为后盾的三枝警官（渡部笃郎饰）的离开和ST新任监查松户紫织（濑户朝香饰）的到来，ST面临生死存亡的危机。赤门渐渐走出家门，百合根则成为遏止这头怪物不可或缺的重要存在……本片根据今野敏的原作改编。
《ST 红白搜查档案》主演演技干脆利落，配乐悠扬悦耳，画面阳光温暖，是一部有着文化底蕴的作品，该剧以热血激昂的女性励志成长故事以及精彩纷呈的进阶智斗之路为主线，交织各角色之间的情感故事，新鲜的叙事角度搭配冲击力十足的吸睛情节，再注入青春、少女、热血等感性元素，给观众焕然一新的观感体验。
