19世纪末沉入新加坡近海，全球最大的蓝宝石“绀青之拳”，被当地的富豪看中想要回收，当他出现的时候，却发生了杀人案现场留下了怪盗基德的血色预告书。另一方面，为了观赏在新加坡举行的空手道比赛，小兰和园子一起来到了新加坡。而没有护照的柯南只能留在日本，不过却被基德用魔术的方法强制带去了新加坡。如果不听话就回不去日本，于是柯南只能被剥夺了眼镜、手表、衣服等等进行变装，当被没认出他来的小兰问到名字时，自称“亚瑟·西莱斯”。基德获悉了沉睡于某宅邸地下金库的绀青之拳的情报，轻松地成功潜入，却发现400战全胜的最强空手道家京极真站在了面前。新加坡的象征滨海湾金沙酒店沾染了鲜血，基德的命运是……在那之后，就如预兆着什么不祥之物一般，从新加坡的象征——鱼尾狮中放出了被染为鲜红的水。
《名侦探柯南：绀青之拳动漫版》故事主线是典型的黑暗童话风格，动漫以童年记忆与生活感触为核心，整体充满了爱与希望，配音具有奇迹般的魔力，影片的设计美妙到让人着迷。画风使人大开眼界，角色设计手法独特，剧情迷人而又充满说服力，特效创意无比，又充满想象力，是一部使思想性和艺术性得到充分展示的动画片。
